Et av verktøyene når man skal masse-analysere store genmengder, er en mikromatrise, en brikke som vanligvis er laget av glass. Ved hjelp av en robot plasserer man titusenvis av genfragmenter i et rutemønster på brikken.

En prøve fra det materiale man vil studere, tilføres brikken. Genetisk materiale som er koplet til et fluoriscerende fargestoff i prøven, vil da binde seg til genmaterialet på platen.

(Tekst: Aashild Sørheim)

Fargen i hver enkelt rute kan avleses og gir informasjon om hvilke gener i prøven som er aktive, inaktive eller overaktive, eller hvor det kan være mutasjoner. Flere hundretusener gener/genbiter kan nå analyseres samtidig på denne måten.

Mikromatrise-analyser er blitt helt nødvendig i moderne cellebiologi og kreftforskning.

Bruken av mikromatriseanalyser gjør at man får en mer pålitelig diagnose. Det gjør det også lettere å velge behandling av den enkelte pasient.

Andre ord som brukes om mikromatrise, er microchip, mikrobrikke eller micro array.

Neste generasjon

Neste generasjon verktøy kalles NGS (next generation sequensing). Denne måten å sekvensere er nå på full til å overta for matrisene. I tillegg til å være kvalitativ er metoden også kvantitativ. Det vil si at man både kan lese stukturen (basesammensetningen) og mengden av den, både med hensyn til kopitall og genuttrykk.

Les med om NGS

Kilde: Professor dr. philos. Anne-Lise Børresen-Dale,forskningssjef Avdeling for Genetikkved Radiumhospitalets forskningsinstitutt